Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC1Q4VXA5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC1Q4VXA5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms