Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRY2Q49AN0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRY2Q49AN0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms