Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms