Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP21-2Q3LI59 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms