Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTC1Q2NKJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTC1Q2NKJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms