Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUOXA1Q1HG43 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DUOXA1Q1HG43 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms