Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRF1Q16656 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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NRF1Q16656 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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NRF1Q16656 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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NRF1Q16656 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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NRF1Q16656 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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NRF1Q16656 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms