Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ECM1Q16610 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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