Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKN1Q16512 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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