Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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