Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85BQ15834 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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