Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHRNA2Q15822 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNA2Q15822 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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