Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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