Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNHIT3Q15649 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms