Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RYR3Q15413 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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