Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABEP1Q15276 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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RABEP1Q15276 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP1Q15276 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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