Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKX1-1Q15270 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms