Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GAPVD1Q14C86 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GAPVD1Q14C86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GAPVD1Q14C86 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms