Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPNMBQ14956 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPNMBQ14956 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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