Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCAPQ14761 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCAPQ14761 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCAPQ14761 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms