Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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