Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM53BQ14153 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms