Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGB1Q14028 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGB1Q14028 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGB1Q14028 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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