Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TUBA3CQ13748 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TUBA3CQ13748 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TUBA3CQ13748 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBA3CQ13748 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBA3CQ13748 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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