Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTCH1Q13635 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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