Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX6Q13608 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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