Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC1Q13547 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC1Q13547 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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