Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF5Q13243 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRSF5Q13243 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF5Q13243 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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