Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NME3Q13232 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME3Q13232 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME3Q13232 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME3Q13232 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME3Q13232 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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