Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
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