Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA4Q13156 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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