Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP4Q13115 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP4Q13115 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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