Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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