Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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