Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXC1Q12948 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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