Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF2Q12933 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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