Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 FLO1YAR050W 4614 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YAK1YJL141C 2424 nt2.76□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RPN6YDL097C 1305 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YMR018WYMR018W 1545 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 MSW1YDR268W 1140 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 UBC8YEL012W 657 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 GTT1YIR038C 705 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YJR128WYJR128W 360 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SIC1YLR079W 855 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RNH203YLR154C 333 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 FLD1YLR404W 858 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YNL320WYNL320W 855 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RSM19YNR037C 276 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 PEP4YPL154C 1218 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 LDH1YBR204C 1128 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RSC1YGR056W 2787 nt2.75□□□□□ -1.97
SME1Q12330 MAL12YGR292W 1755 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 MAL32YBR299W 1755 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 CSR2YPR030W 3366 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SPP382YLR424W 2127 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 EXO70YJL085W 1872 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RPL30YGL030W 318 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YGR039WYGR039W 312 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YVH1YIR026C 1095 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YKR011CYKR011C 1062 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RPN13YLR421C 471 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YBL028CYBL028C 321 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YNL184CYNL184C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SAS5YOR213C 747 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 MET5YJR137C 4329 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 REG1YDR028C 3045 nt2.74□□□□□ -1.97
SME1Q12330 VPS33YLR396C 2076 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 UTP11YKL099C 753 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YLR042CYLR042C 486 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RPS28BYLR264W 204 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 POP8YBL018C 402 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YNR042WYNR042W 429 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YNR062CYNR062C 984 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SPH1YLR313C 1593 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SLA1YBL007C 3735 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 REC8YPR007C 2043 nt2.73□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SUP45YBR143C 1314 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 TEC1YBR083W 1461 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 STP2YHR006W 1626 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RPS25AYGR027C 327 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 PHO81YGR233C 3537 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 IMP3YHR148W 552 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 FIP1YJR093C 984 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 RPS10BYMR230W 318 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 YOR062CYOR062C 807 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 PFY1YOR122C 381 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 SYC1YOR179C 567 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 PLP2YOR281C 861 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 TFC1YBR123C 1950 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 TOM1YDR457W 9807 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 FUN30YAL019W 3396 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 DYN1YKR054C 12279 nt2.72□□□□□ -1.97
SME1Q12330 UBP8YMR223W 1416 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 MOT1YPL082C 5604 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YDL050CYDL050C 372 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 ARF1YDL192W 546 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YEL075CYEL075C 369 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 ARI1YGL157W 1044 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 PAU13YHL046C 363 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 LAC1YKL008C 1257 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 SWD2YKL018W 990 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 RPC37YKR025W 849 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YMR010WYMR010W 1218 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 IRC14YOR135C 342 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 ATG5YPL149W 885 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 DUN1YDL101C 1542 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 LTV1YKL143W 1392 nt2.71□□□□□ -1.98
SME1Q12330 RPN1YHR027C 2982 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 UBP5YER144C 2418 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 DOG2YHR043C 741 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YKL162CYKL162C 1209 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 PRM4YPL156C 855 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 ARA1YBR149W 1035 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 FAR1YJL157C 2493 nt2.7□□□□□ -1.98
SME1Q12330 TCP1YDR212W 1680 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YMR317WYMR317W 3423 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 BCH1YMR237W 2175 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YDR535CYDR535C 501 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 CNN1YFR046C 1086 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YIL161WYIL161W 708 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YLL037WYLL037W 381 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 ENV10YLR065C 546 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 AAR2YBL074C 1068 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 FIG1YBR040W 897 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 VPS3YDR495C 3036 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 YCG1YDR325W 3108 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 VIP1YLR410W 3441 nt2.69□□□□□ -1.98
SME1Q12330 MTL1YGR023W 1656 nt2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms