Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YPL162CYPL162C 822 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 URK1YNR012W 1506 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YCF1YDR135C 4548 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YVC1YOR087W 2028 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 TPA1YER049W 1935 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RVS161YCR009C 798 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YCR085WYCR085W 354 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 NHP10YDL002C 612 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RPS0AYGR214W 759 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PET130YJL023C 1044 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RPL18BYNL301C 561 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YOR186WYOR186W 435 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 POP7YBR167C 423 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 GDT1YBR187W 843 nt4.43□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 DHR2YKL078W 2208 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 LTV1YKL143W 1392 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 TRK1YJL129C 3708 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 UBC9YDL064W 474 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PLM2YDR501W 1566 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YGR115CYGR115C 780 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YVH1YIR026C 1095 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YJR128WYJR128W 360 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 ACE2YLR131C 2313 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 MPP6YNR024W 561 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 DGA1YOR245C 1257 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 ERV15YBR210W 429 nt4.42□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PEP7YDR323C 1548 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 ULS1YOR191W 4860 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 BI3Q0115 1554 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 FMP10YER182W 735 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 THP2YHR167W 786 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 STE18YJR086W 333 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YKL131WYKL131W 522 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 DSL1YNL258C 2265 nt4.41□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RPO21YDL140C 5202 nt4.4□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 FAR8YMR029C 1572 nt4.4□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PRP3YDR473C 1410 nt4.4□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 SNO3YFL060C 669 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RSM25YIL093C 795 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SYS1YJL004C 612 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 APQ13YJL075C 417 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SNO2YNL334C 669 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 PCI8YIL071C 1335 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 TAF6YGL112C 1551 nt4.4□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SSH1YBR283C 1473 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 IOC2YLR095C 2439 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YOS1YER074W-A 258 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 OTU1YFL044C 906 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 PGD1YGL025C 1194 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 GIC1YHR061C 945 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 AIM22YJL046W 1230 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RPS30AYLR287C-A 192 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YML053CYML053C 639 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 IRC21YMR073C 606 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YNL035CYNL035C 1170 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ASI2YNL159C 870 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 IST1YNL265C 897 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ARF3YOR094W 552 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RIM4YHL024W 2142 nt4.39□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 CBS1YDL069C 690 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 TDA10YGR205W 873 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YGR293CYGR293C 462 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 CPR7YJR032W 1182 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 COS1YNL336W 1146 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ATP19YOL077W-A 207 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YBR071WYBR071W 636 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YPR172WYPR172W 603 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YBR300CYBR300C 498 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 GEM1YAL048C 1989 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 VHS3YOR054C 2025 nt4.38□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ISW2YOR304W 3363 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ACA1YER045C 1470 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 VPS73YGL104C 1461 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 GAL11YOL051W 3246 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 TPD3YAL016W 1908 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 EMC1YCL045C 2283 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 NSE4YDL105W 1209 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 OCA6YDR067C 675 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 NKP1YDR383C 717 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 GUK1YDR454C 564 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 HIS5YIL116W 1158 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RLP24YLR009W 600 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 AHP1YLR109W 531 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 MOH1YBL049W 417 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 PEX15YOL044W 1152 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 CUP9YPL177C 921 nt4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms