Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 CBP4YGR174C 513 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RPL39YJL189W 156 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 TPK3YKL166C 1197 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YLR434CYLR434C 384 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 NRM1YNR009W 750 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 CAM1YPL048W 1248 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 snR24snR24 89 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 TDA3YHR009C 1572 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 DPH2YKL191W 1605 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ALT1YLR089C 1779 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 APM2YHL019C 1818 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YPK2YMR104C 2034 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 DSS1YMR287C 2910 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 BZZ1YHR114W 1902 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 PLM2YDR501W 1566 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 FRS2YFL022C 1512 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ALD6YPL061W 1503 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 DPB4YDR121W 591 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YEL068CYEL068C 333 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 SEC53YFL045C 765 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YNL184CYNL184C 327 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 MET31YPL038W 534 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 LSG1YGL099W 1923 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RTK1YDL025C 1863 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ASH1YKL185W 1767 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 MCP2YLR253W 1710 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 DSF1YEL070W 1509 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YNR073CYNR073C 1509 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YER038W-AYER038W-A 381 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YER085CYER085C 522 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 ZRT1YGL255W 1131 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RNR4YGR180C 1038 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 NHA1YLR138W 2958 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YNL285WYNL285W 372 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RPL18BYNL301C 561 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YPR114WYPR114W 948 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 YCL023CYCL023C 348 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 RFA1YAR007C 1866 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BLQ12266 DBP3YGL078C 1572 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 CTK1YKL139W 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 STE13YOR219C 2796 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 HIR1YBL008W 2523 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 SSF2YDR312W 1362 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 API2YDR525W 330 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 ERV1YGR029W 570 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 CAB4YGR277C 918 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YHR097CYHR097C 1101 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YKL107WYKL107W 930 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 RHO4YKR055W 876 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 MRPS16YPL013C 366 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 ICL1YER065C 1674 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 HAP4YKL109W 1665 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 DAL5YJR152W 1632 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 MSS1YMR023C 1581 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 CBP1YJL209W 1965 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 MET3YJR010W 1536 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 SAC6YDR129C 1929 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 IOC4YMR044W 1428 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YLL067CYLL067C 3618 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 CDC36YDL165W 576 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YDR015CYDR015C 240 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 ECO1YFR027W 846 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 RPL1BYGL135W 654 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YKL070WYKL070W 510 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 AFB1YLR040C 675 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YPL107WYPL107W 747 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 RPL1AYPL220W 654 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 GCD2YGR083C 1956 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 VMS1YDR049W 1899 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 FUS1YCL027W 1539 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 CRZ1YNL027W 2037 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YDL109CYDL109C 1944 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 ARP2YDL029W 1176 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YDR102CYDR102C 333 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 APS3YJL024C 585 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 VTI1YMR197C 654 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 SOL1YNR034W 966 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YOL131WYOL131W 327 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 snR36snR36 182 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 IRS4YKR019C 1848 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 DIT2YDR402C 1470 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 GNT1YOR320C 1476 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 CHA4YLR098C 1947 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 MSE1YOL033W 1611 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 GUA1YMR217W 1578 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 MCM3YEL032W 2916 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YCL068CYCL068C 783 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BLQ12266 YDL218WYDL218W 954 nt5.3□□□□□ -1.56
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