Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YOL098CYOL098C 3114 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 HPR1YDR138W 2259 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 TMC1YOR052C 453 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SAS5YOR213C 747 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YMR046CYMR046C 1323 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YBR259WYBR259W 2067 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 EMI1YDR512C 564 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 ISC10YER180C 804 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 RPS23AYGR118W 438 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YLR122CYLR122C 378 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 RPS23BYPR132W 438 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 PUT2YHR037W 1728 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 FLO1YAR050W 4614 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 NUP159YIL115C 4383 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 ESL1YIL151C 3357 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 RPL17BYJL177W 555 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 PFY1YOR122C 381 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 BET1YIL004C 429 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SYS1YJL004C 612 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YKL131WYKL131W 522 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 RRG8YPR116W 834 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 RPO21YDL140C 5202 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SBE22YHR103W 2559 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YGL159WYGL159W 1113 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SAE3YHR079C-A 276 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YBL065WYBL065W 345 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 MFM1YPL060W 1242 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 UBP6YFR010W 1500 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 KHA1YJL094C 2622 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 KAR5YMR065W 1515 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SPO1YNL012W 1896 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 MYO4YAL029C 4416 nt3.21□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 UNG1YML021C 1080 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 BUD4YJR092W 4344 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 IXR1YKL032C 1794 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 TAF6YGL112C 1551 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 RNA14YMR061W 2034 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 OAF3YKR064W 2592 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 PDS1YDR113C 1122 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 CIR1YGR207C 786 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 FYV12YOR183W 390 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 HST2YPL015C 1074 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 REB1YBR049C 2433 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 HUG1YML058W-A 207 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 AMS1YGL156W 3252 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 TOR1YJR066W 7413 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 RPL25YOL127W 429 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 ADR1YDR216W 3972 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 YSP2YDR326C 4317 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 GLN4YOR168W 2430 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 BUD2YKL092C 3315 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 ECM5YMR176W 4236 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 YAR009CYAR009C 3591 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 YHL045WYHL045W 348 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 YHR210CYHR210C 1026 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 RSM19YNR037C 276 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 RFC5YBR087W 1065 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 ECM7YLR443W 1347 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 SEF1YBL066C 3447 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 JJJ3YJR097W 519 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 APN2YBL019W 1563 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-BRQ12193 TRM3YDL112W 4311 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 VPS27YNR006W 1869 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 ARP7YPR034W 1434 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 PRP8YHR165C 7242 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 WHI4YDL224C 1950 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 COS111YBR203W 2775 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 SPI1YER150W 447 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 BNA4YBL098W 1383 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 RCY1YJL204C 2523 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 HRD3YLR207W 2502 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 FMP10YER182W 735 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 BPT1YLL015W 4680 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 HRD1YOL013C 1656 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 CYC1YJR048W 330 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 ATG19YOL082W 1248 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 NIC96YFR002W 2520 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 NUP192YJL039C 5052 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 ISM1YPL040C 3009 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 SEY1YOR165W 2331 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 RAD5YLR032W 3510 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 BNI4YNL233W 2679 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 FAS1YKL182W 6156 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 ELP3YPL086C 1674 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 LIF1YGL090W 1266 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 ALG14YBR070C 714 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 KAP95YLR347C 2586 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 ARD1YHR013C 717 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 RPL36AYMR194W 303 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-BRQ12193 FRM2YCL026C-A 582 nt3.09□□□□□ -1.91
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