Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMOD3Q0VAK6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMOD3Q0VAK6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms