Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL9Q07325 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms