Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL16A1Q07092 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL16A1Q07092 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms