Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 CLB3YDL155W 1284 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MCM21YDR318W 1107 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 PIR1YKL164C 1026 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YBL081WYBL081W 1107 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SIL1YOL031C 1266 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 XRN1YGL173C 4587 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 DSN1YIR010W 1731 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 EPO1YMR124W 2832 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YGR117CYGR117C 1431 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 CBP2YHL038C 1893 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 EXO70YJL085W 1872 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 ABD1YBR236C 1311 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 VAS1YGR094W 3315 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MSS2YDL107W 1056 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 IRC6YFR043C 714 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 DUO1YGL061C 744 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YGR149WYGR149W 1299 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YIL174WYIL174W 228 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 RPS22AYJL190C 393 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 HPA2YPR193C 471 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YPR203WYPR203W 309 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 ARO4YBR249C 1113 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YGR237CYGR237C 2358 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 AGA1YNR044W 2178 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 CTK1YKL139W 1587 nt2.66□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MSA1YOR066W 1890 nt2.65□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 RPC11YDR045C 333 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YDR491CYDR491C 492 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 AST2YER101C 1293 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 FMP32YFL046W 624 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 COX23YHR116W 456 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 MTR2YKL186C 555 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YKR033CYKR033C 426 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SSN8YNL025C 972 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 snR42snR42 351 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PRP8YHR165C 7242 nt2.65□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 ILS1YBL076C 3219 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YVC1YOR087W 2028 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 JSN1YJR091C 3276 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YCR007CYCR007C 720 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PEX21YGR239C 867 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 GLG2YJL137C 1143 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 ATG27YJL178C 816 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 GTT2YLL060C 702 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 RCE1YMR274C 948 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 UAF30YOR295W 687 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YPL071CYPL071C 471 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 REG2YBR050C 1017 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 RPL33AYPL143W 324 nt2.64□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PAU10YDR542W 363 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PAU11YGL261C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PAU13YHL046C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SDS3YIL084C 984 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YJL175WYJL175W 513 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 CPR7YJR032W 1182 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 MSA2YKR077W 1092 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 BUR2YLR226W 1188 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PAU4YLR461W 363 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 RPS11BYBR048W 471 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YPR050CYPR050C 414 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SMC2YFR031C 3513 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 ADY4YLR227C 1482 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PMS1YNL082W 2622 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 MTH1YDR277C 1302 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 VBA4YDR119W 2307 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 ECM21YBL101C 3354 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SLH1YGR271W 5904 nt2.63□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 MRH1YDR033W 963 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SHU2YDR078C 672 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 WBP1YEL002C 1293 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 EDC1YGL222C 528 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 AGE2YIL044C 897 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 HRT1YOL133W 366 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SPS4YOR313C 1017 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 USV1YPL230W 1176 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 TPD3YAL016W 1908 nt2.62□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 NSA1YGL111W 1392 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 CLG1YGL215W 1359 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 KIN82YCR091W 2163 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SRB8YCR081W 4284 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PHO5YBR093C 1404 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 SAP1YER047C 2694 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 GRX6YDL010W 696 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 DTD1YDL219W 453 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 NSE3YDR288W 912 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PET130YJL023C 1044 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 RAD10YML095C 633 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 RRG9YNL213C 645 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 YBL094CYBL094C 333 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 NDJ1YOL104C 1059 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 TUM1YOR251C 915 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 PDC2YDR081C 2778 nt2.61□□□□□ -1.99
NEJ1Q06148 MGR3YMR115W 1506 nt2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.2 ms