Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 KIN3YAR018C 1308 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PUF6YDR496C 1971 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MIP6YHR015W 1980 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 VPS3YDR495C 3036 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PRP8YHR165C 7242 nt2.87□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MSH2YOL090W 2895 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 APM1YPL259C 1428 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RPA190YOR341W 4995 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 SHU2YDR078C 672 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YPR1YDR368W 939 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 VMA8YEL051W 771 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CGR1YGL029W 363 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YHL005CYHL005C 393 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YAR069CYAR069C 294 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 YLR297WYLR297W 390 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RPL6AYML073C 531 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CSM3YMR048W 954 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PPT2YPL148C 522 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 NTO1YPR031W 2247 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 STE6YKL209C 3873 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 KRE2YDR483W 1329 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CDC20YGL116W 1833 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 ATG26YLR189C 3597 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RAX2YLR084C 3663 nt2.86□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 HAP4YKL109W 1665 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MET5YJR137C 4329 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 AEP3YPL005W 1821 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 MSS2YDL107W 1056 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 BSC2YDR275W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 THO1YER063W 657 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 THP2YHR167W 786 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CSM2YIL132C 642 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RNH203YLR154C 333 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 AAR2YBL074C 1068 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RFM1YOR279C 933 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 HFD1YMR110C 1599 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 TOM70YNL121C 1854 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 TSC11YER093C 4293 nt2.85□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CIK1YMR198W 1785 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 ACA1YER045C 1470 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 EPL1YFL024C 2499 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 BSC1YDL037C 987 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 ERG26YGL001C 1050 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PPX1YHR201C 1194 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 RPA43YOR340C 981 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 CYR1YJL005W 6081 nt2.84□□□□□ -1.95
YMR226CQ05016 PDC2YDR081C 2778 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YCR085WYCR085W 354 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 OPI6YDL096C 327 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 CDC26YFR036W 375 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YGR149WYGR149W 1299 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 GLG2YJL137C 1143 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 VMA5YKL080W 1179 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YNL109WYNL109W 546 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 MDM1YML104C 3384 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YGR067CYGR067C 2415 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 STE24YJR117W 1362 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 CHS3YBR023C 3498 nt2.83□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 HEH2YDR458C 1992 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 RRT13YER066W 558 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YLR444CYLR444C 303 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 MFA2YNL145W 117 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YOR385WYOR385W 873 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 OXR1YPL196W 822 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PBI1YPL272C 1554 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YLR278CYLR278C 4026 nt2.82□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 RPS14AYCR031C 414 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 RRP1YDR087C 837 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PFY1YOR122C 381 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PST1YDR055W 1335 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YKR015CYKR015C 1707 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 DIA2YOR080W 2199 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 EXO84YBR102C 2262 nt2.81□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YDL199CYDL199C 2064 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YDR355CYDR355C 303 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 EFG1YGR271C-A 702 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 SSU72YNL222W 621 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YOR263CYOR263C 408 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PHO88YBR106W 567 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YBR300CYBR300C 498 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 RGC1YPR115W 3252 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 BEM4YPL161C 1902 nt2.8□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 RAD7YJR052W 1698 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PNC1YGL037C 651 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PEX14YGL153W 1026 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YGR160WYGR160W 612 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YGR219WYGR219W 342 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 EMC2YJR088C 879 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 TDA8YAL064C-A 381 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YLL037WYLL037W 381 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 RPL20AYMR242C 519 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 CAF20YOR276W 486 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PIN4YBL051C 2007 nt2.79□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YAT2YER024W 2772 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 MPC54YOR177C 1395 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 YLR225CYLR225C 1224 nt2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.8 ms