Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP1Q04837 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms