Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT17Q04695 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms