Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNC1Q01954 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms