Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD4Q01804 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD4Q01804 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms