Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAP1Q01518 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAP1Q01518 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms